• 白鴎高等学校附属中学校（台東地区２００５年度開校）
• 小石川中等教育学校（文京地区２００６年開校）
• 両国高等学校附属中学校（墨田地区２００６年開校）
• 桜修館中等教育学校（目黒地区２００６年開校）
• 千代田区立九段中等教育学校（千代田区立２００６年開校）
• 北多摩高校（立川地区２００８年度開校予定）
• 武蔵高校（武蔵野地区２００８年度開校予定）
• 富士高校（中野地区２０１０年開校予定）
• 大泉高校（練馬地区２０１０年開校予定）
• 南多摩高校（八王子地区２０１０年開校予定）
• 三鷹高校（三鷹地区２０１０年開校予定）

中高一貫タイプの学校は都立中学（３年間＝都立の附属中学という位置づけ）から都立高校（３年間）のあわせて６年間の教育を受ける。中学から高校へ進学する場合入試はない。高校では外部の中学から募集を行う。

中等教育学校（小石川、都立大附属、北多摩など）は中学と高校を分けず６年間の一貫教育を行う。中学三年間を前期課程、高校３年間を後期課程と位置づけ、中学から高校への入学試験はない。高校から外部の募集はない。